分子胚胎學(xué)

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分子胚胎學(xué)(molecular embryology),胚胎學(xué)分支學(xué)科,研究動(dòng)物胚胎發(fā)育過程中生長、分化和形態(tài)發(fā)生的分子基礎(chǔ)。它在70年代出現(xiàn),是胚胎學(xué)不斷向分子水平深入發(fā)展的結(jié)果。
  化學(xué)胚胎學(xué)的研究說明細(xì)胞分化的基礎(chǔ)是蛋白質(zhì)大分子(酶、結(jié)構(gòu)蛋白等)的專一合成。然而,這些研究多停留在對發(fā)育過程中表型變化的生化描述,還未能深入闡明這種合成活動(dòng)的遺傳基礎(chǔ)。50年代以來,分子生物學(xué)取得的重大成就,促進(jìn)了從分子水平研究發(fā)育問題。分子生物學(xué)在微生物中發(fā)現(xiàn)的遺傳信息傳遞的“中心法則”,揭示了生物的發(fā)育、遺傳和進(jìn)化的內(nèi)在聯(lián)系。同時(shí),也指出只有根據(jù)發(fā)育和遺傳統(tǒng)一的觀點(diǎn),從分子水平來研究發(fā)育問題才能闡明發(fā)育的根本原因。細(xì)胞核移植實(shí)驗(yàn)證明高等動(dòng)物已分化細(xì)胞的核可能含有全套遺傳信息,而其中只有一小部分表現(xiàn)功能活動(dòng),說明細(xì)胞分化是基因選擇性表達(dá)的結(jié)果。從分子水平來看,細(xì)胞分化和性狀發(fā)育都是由于合成表型專一的蛋白質(zhì)大分子。因此,無比復(fù)雜的胚胎發(fā)育過程,可以簡化為從基因到合成表型專一大分子和從大分子的裝配到產(chǎn)生特定的形態(tài)結(jié)構(gòu)兩個(gè)步驟,用分子生物學(xué)方法來加以分析,其關(guān)鍵是發(fā)育過程中基因表達(dá)的時(shí)、空秩序問題。
  70年代以來,核酸分子結(jié)構(gòu)和功能的研究方法日臻完善,尤其是重組DNA技術(shù)的發(fā)明和進(jìn)展,為研究基因在發(fā)育中的表達(dá)和調(diào)控,提供了有力的手段。因而越來越多的分子生物學(xué)家轉(zhuǎn)向研究發(fā)育問題,他們把在解決遺傳問題時(shí)發(fā)展起來的新方法和新概念,用來分析發(fā)育的分子機(jī)制,由此逐漸形成了分子胚胎學(xué)。
  分子胚胎學(xué)的主要內(nèi)容是:
  發(fā)育過程中的基因表達(dá)及其調(diào)控  從分子胚胎學(xué)的觀點(diǎn)看來,全部發(fā)育問題可以大致表述為:卵子發(fā)生和成熟過程中,發(fā)育信息如何儲(chǔ)存在卵的結(jié)構(gòu)內(nèi);經(jīng)過受精而引起發(fā)育的卵細(xì)胞又如何通過核質(zhì)之間、分裂球之間,以及胚胎不同部位之間的相互作用,使基因按一定的時(shí)、空秩序選擇性地表達(dá),從而控制專一蛋白質(zhì)的合成和裝配,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的分化和個(gè)體的發(fā)育。
  個(gè)體發(fā)育不同時(shí)期,基因表達(dá)的調(diào)控可能在不同水平(轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后的加工、翻譯)上,以各種不同的機(jī)制進(jìn)行。其中一些機(jī)制與遺傳物質(zhì)本身的改變(基因的缺失、放大、移位重組、修飾以及染色質(zhì)構(gòu)造變化等)有關(guān),另一些則沒有這些改變,而只是涉及基因表達(dá)過程的不同環(huán)節(jié)(基因及其轉(zhuǎn)錄本RNA的選擇和利用、mRNA存活時(shí)間長短等) 的調(diào)節(jié)。多基因族在調(diào)節(jié)基因表達(dá)的數(shù)量、多樣性和時(shí)間程序上也起著重要的作用。
  某些脊椎動(dòng)物和昆蟲的卵子發(fā)生過程中,核糖體核糖核酸(rRNA)基因通過基因擴(kuò)增而大量增加,以適應(yīng)早期發(fā)育中迅速合成大量核糖體的需要。果蠅卵巢卵泡細(xì)胞卵殼蛋白基因,在開始迅速合成這些蛋白質(zhì)前,先大量復(fù)制而擴(kuò)增。這是已知正常發(fā)育過程中,編碼蛋白質(zhì)的基因擴(kuò)增的第一個(gè)例子。從受精到卵裂,所需的發(fā)育信息是在卵子發(fā)生過程中,以“掩蓋的”信使核糖核酸形式儲(chǔ)存在卵質(zhì)內(nèi)的。受精時(shí),“掩蓋的”mRNA被激活,開動(dòng)蛋白質(zhì)合成系統(tǒng)而引起發(fā)育。這說明在早期發(fā)育中,基因表達(dá)可能存在翻譯水平的調(diào)節(jié)。從囊胚原腸胚以后,轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平(包括mRNA加工和選擇性輸送)的調(diào)節(jié),成為主要的調(diào)控方式。然而,在組織、器官的終末分化過程中,如紅細(xì)胞發(fā)生、胰上皮細(xì)胞晶狀體細(xì)胞的分化中,仍然可能先合成“掩蓋的”mRNA,再轉(zhuǎn)入活動(dòng)狀態(tài),合成表型專一的蛋白質(zhì)分子,然后再裝配成具有特定功能的結(jié)構(gòu)單位,表現(xiàn)出可見的形態(tài)分化。在此過程中,激素等因子可能影響mRNA的穩(wěn)定性,改變其存活時(shí)間。70年代末還發(fā)現(xiàn)B淋巴細(xì)胞分化中,免疫球蛋白基因表達(dá)的調(diào)節(jié)是在DNA水平,通過V、D、J、C基因片段的移位重組機(jī)制實(shí)現(xiàn)的。除已知酵母交配型的轉(zhuǎn)換存在類似的機(jī)制外,在高等真核生物細(xì)胞分化中,這種機(jī)制有無普遍意義還不清楚(見免疫遺傳學(xué))。
  動(dòng)物發(fā)育過程中基因表達(dá)的另一個(gè)特點(diǎn)是存在多基因族,即合成相似功能的蛋白質(zhì)的一組核苷酸順序略有不同的一些基因(如肌動(dòng)蛋白微管蛋白等的同族異構(gòu)基因)或功能上相關(guān)的多個(gè)基因(如各種 α型和β型珠蛋白基因)簇集在染色質(zhì)的一定區(qū)段上。這些基因能按一定程序在時(shí)、空上(不同發(fā)育時(shí)期,不同組織、細(xì)胞內(nèi))先后不同地、分別地表達(dá)。如雞胚紅細(xì)胞發(fā)育過程中,珠蛋白基因表達(dá)的轉(zhuǎn)換是同有關(guān)的染色質(zhì)從不活躍的結(jié)構(gòu)(對DNA酶I不敏感,甲基化程度高)到活躍結(jié)構(gòu)(對DNA酶I敏感)的轉(zhuǎn)變密切相關(guān)的。實(shí)際上,在發(fā)育過程中,染色體在形態(tài)上發(fā)生的種種明顯的變化(消減、燈刷染色體多線染色體的出現(xiàn)及異染色質(zhì)化等),與此相應(yīng)的 DNA的甲基化、超螺旋程度、核小體相位關(guān)系及包裝狀態(tài)等分子水平的變化,都可能選擇地影響基因的功能活動(dòng)。
  實(shí)驗(yàn)胚胎學(xué)的早期研究已注意到卵質(zhì)內(nèi)可能存在基因調(diào)控物質(zhì),如雙翅目昆蟲卵的極質(zhì)決定生殖細(xì)胞的發(fā)育;馬副蛔蟲植物極卵質(zhì)使染色質(zhì)不發(fā)生消減,都是著名的例子。兩棲類細(xì)胞核移植實(shí)驗(yàn)更證明早期發(fā)育中,核內(nèi)基因表達(dá)受細(xì)胞質(zhì)控制。如將爪蟾的腎細(xì)胞核移植到有肋螈的卵母細(xì)胞內(nèi),在卵質(zhì)成分影響下,腎細(xì)胞核的基因表達(dá)程序重新編排,結(jié)果腎細(xì)胞的專一的基因活動(dòng)被抑制,而卵母細(xì)胞專一的基因活動(dòng)被激活,使接受腎細(xì)胞核的卵母細(xì)胞繼續(xù)合成卵母細(xì)胞的專一蛋白質(zhì)。70年代以來,把用DNA純系擴(kuò)增得到的5SRNA純基因,輸入從爪蟾卵母細(xì)胞核提取物制備的離體轉(zhuǎn)錄系統(tǒng),發(fā)現(xiàn)5SRNA基因的調(diào)控部位位于該基因的中段,而不是象原核生物那樣位于5′端;并且,還從卵質(zhì)中找到一個(gè)專一的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,能與 5SRNA基因調(diào)控部位選擇地結(jié)合。目前,純基因和 DNA序列分析在發(fā)育遺傳問題研究中正得到日益廣泛的應(yīng)用。
  目前分子胚胎學(xué)研究大都沿用兩棲類和海膽等實(shí)驗(yàn)胚胎學(xué)的傳統(tǒng)研究材料。這些動(dòng)物的突變型少、遺傳背景不清楚,加之繁殖周期長,在遺傳分析上十分不便。因此,一些有遠(yuǎn)見的分子生物學(xué)家主張采用發(fā)育較簡單的一種營自由生活的秀麗隱桿線蟲作材料。這種線蟲的身體和各器官的細(xì)胞數(shù)目恒定,數(shù)量又少。胚胎發(fā)育為鑲嵌型,有確定的細(xì)胞譜系可循。另一方面,基因數(shù)目少(約2000個(gè)可鑒定的基因),易于用實(shí)驗(yàn)方法得到突變型。目前對秀麗隱桿線蟲從分子水平研究發(fā)育遺傳已很活躍。有人預(yù)言,秀麗隱桿線蟲在分子胚胎學(xué)的發(fā)展中,可望起大腸桿菌分子遺傳學(xué)的發(fā)展中所起過的重要作用。
  形態(tài)發(fā)生的分子基礎(chǔ)  發(fā)育過程中,由于基因選擇表達(dá)產(chǎn)生的專一大分子如何裝配成基本的結(jié)構(gòu)單位,再形成細(xì)胞器,以至細(xì)胞、組織和器官等各級形態(tài)構(gòu)造的問題,是分子胚胎學(xué)研究的另一個(gè)方面。
  現(xiàn)在已知道許多超分子構(gòu)造(病毒、多酶系、核糖體和膜等)都能在沒有外加信息的條件下,從組成它們的亞基通過非共價(jià)連接(疏水性相互作用、離子鍵和氫鍵)自行裝配形成。這一過程稱為大分子的自裝配。大多數(shù)超分子體系中,自裝配所需的信息是由蛋白質(zhì)亞基提供的,而在另一些體系(如煙草花葉病毒、核糖體等)中,蛋白質(zhì)亞基和RNA都能提供裝配信息。此外,在膜層建造中,磷脂分子也能提供這類信息。
  由遺傳決定的蛋白質(zhì)亞基的氨基酸順序包含有形成超分子構(gòu)造的雙重信息。在一個(gè)水平上,亞基多肽鏈一級結(jié)構(gòu)(氨基酸順序)決定該亞基的三維構(gòu)象。同時(shí),在另一個(gè)水平上,每一個(gè)亞基的三維構(gòu)象又含有同相鄰亞基間的識(shí)別和結(jié)合的部位,各亞基借此按一定的空間關(guān)系形成特定蛋白質(zhì)大分子的四級結(jié)構(gòu)。然后,再通過蛋白質(zhì)大分子之間,以及蛋白質(zhì)同核酸、磷脂分子之間特定的相互作用,從超分子構(gòu)造到細(xì)胞器,逐級地裝配成越來越復(fù)雜的形態(tài)構(gòu)造。
  大腸桿菌的T4噬菌體可以作為研究形態(tài)發(fā)生的遺傳控制和分子基礎(chǔ)的模型。T4噬菌體的形狀象一個(gè)注射器,具有頭、尾和尾絲等復(fù)雜的形態(tài)構(gòu)造。這些構(gòu)造及其裝配是由40多個(gè)基因決定的。對這些基因之溫度敏感的致死突變型進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)表明,噬菌體在形態(tài)發(fā)生過程中,先是頭、尾和尾絲3個(gè)部分分別沿3條“裝配線”按一定順序裝配形成;然后,這些部件再按一定順序總裝成一個(gè)完整的病毒顆粒。全部過程中,除去一個(gè)步驟(尾絲和底盤的連接)需酶的催化反應(yīng)外,其余各步驟均為非共價(jià)連接的自裝配過程。這種自裝配過程表現(xiàn)出一定的順序性和協(xié)同作用,上一個(gè)亞基的裝配是促成下一個(gè)亞基裝配的條件。另一個(gè)有趣的例子是鼠傷寒菌之P22噬菌體頭部的形態(tài)發(fā)生。這種噬菌體的頭部是由 420個(gè)相同的蛋白質(zhì)亞基,在另一種“支架蛋白”的支持下,裝配形成的。支架蛋白本身并不參加頭部的構(gòu)成,拆除后還可供下次再度使用。從以上兩個(gè)例子可以看出由 DNA決定的、編排在蛋白質(zhì)亞基氨基酸順序里的一維信息,如何產(chǎn)生出高度復(fù)雜的三維形態(tài)構(gòu)造的蛛絲馬跡。雖然,噬菌體的構(gòu)造遠(yuǎn)比細(xì)胞簡單,其形態(tài)發(fā)生的復(fù)雜性更不能同胚胎的形態(tài)發(fā)生相提并論,但對于了解細(xì)胞器的建造仍有可借鑒之處。實(shí)際上,在核糖體30S亞基的重組實(shí)驗(yàn)中已發(fā)現(xiàn),其21個(gè)蛋白質(zhì)組分和16SRNA同樣是按一定順序并協(xié)同地自裝配的。此外,還發(fā)現(xiàn)細(xì)胞的各種基本結(jié)構(gòu)和功能單位(如微管、細(xì)菌鞭毛、各種多酶體系,以及肌原纖維的粗絲等)的建造,都表現(xiàn)自裝配現(xiàn)象。值得注意的是細(xì)菌鞭毛的亞基,必需要有一段現(xiàn)成的鞭毛作為“晶種”的情況下,自裝配過程才能進(jìn)行。
  形態(tài)發(fā)生之分子基礎(chǔ)的研究還可在更高的水平上進(jìn)行。用形成細(xì)胞骨架的各種蛋白質(zhì)(如微管蛋白、肌動(dòng)蛋白、輔肌動(dòng)蛋白、原肌球蛋白細(xì)胞角蛋白,支條蛋白和紐帶蛋白等)的專一抗體免疫細(xì)胞化學(xué)方法,及各種藥物(如秋水仙素、細(xì)胞松弛素B等),可以研究這些蛋白質(zhì)在細(xì)胞形態(tài)的建造和維持中的作用。這方面的研究發(fā)現(xiàn),這些蛋白質(zhì)在胚胎發(fā)育過程中的出現(xiàn)和活動(dòng),同胚胎的形態(tài)發(fā)生運(yùn)動(dòng)和細(xì)胞形態(tài)分化有密切關(guān)系。至于各種細(xì)胞如何進(jìn)一步形成組織和器官,則涉及細(xì)胞表面問題。
  細(xì)胞表面  細(xì)胞表面擔(dān)負(fù)著細(xì)胞間識(shí)別、信息傳遞、物質(zhì)交換以及運(yùn)動(dòng)等重要功能。兩棲類原腸胚各胚層的細(xì)胞之間表現(xiàn)出的選擇親和性,以及視網(wǎng)膜等組織細(xì)胞選擇聚合實(shí)驗(yàn),都表明細(xì)胞識(shí)別在形態(tài)發(fā)生和組織分化中起重要作用(見細(xì)胞的親和性)。在胚胎發(fā)育中,細(xì)胞間識(shí)別的分子基礎(chǔ)還不甚清楚。但有證據(jù)提示可能同細(xì)胞表面糖蛋白大分子有密切關(guān)系。從雞胚視網(wǎng)膜細(xì)胞表面已分離出的一種具有組織專一性的細(xì)胞凝聚因子,是分子量為 50000的糖蛋白。海鞘卵從受精到卵裂的過程中,雙花扁豆凝集素受體的分布發(fā)生有規(guī)則的變化:從原來分散在整個(gè)卵表面,逐漸聚中到植物極,然后,再局限到將來產(chǎn)生尾部肌肉的B4,1裂球內(nèi)。這提示發(fā)育過程中細(xì)胞表面糖基團(tuán)的改變可能同細(xì)胞系的分離有關(guān)。
  神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育中,腦內(nèi)神經(jīng)原網(wǎng)絡(luò)圖式的建立,神經(jīng)纖維的定向生長,以及神經(jīng)嵴細(xì)胞的遷移等,都可能同細(xì)胞表面特性有關(guān)。視覺系統(tǒng)發(fā)育過程中,網(wǎng)膜軸突和腦頂蓋間的特定聯(lián)系的建立機(jī)制,多年來一直是最令人感興趣的問題。70年代以來,發(fā)現(xiàn)腦頂蓋細(xì)胞膜和網(wǎng)膜神經(jīng)突起間的親和性,表現(xiàn)出沿網(wǎng)膜前后軸的梯度差異。此外,還在雞胚網(wǎng)膜上發(fā)現(xiàn)一種抗原,其濃度沿網(wǎng)膜的腹前-背后軸呈梯度分布,推測這種抗原可能作為網(wǎng)膜細(xì)胞位置的標(biāo)記。
  胚胎細(xì)胞間存在能容許分子量從1300~1900之間的小分子通過的間隙連結(jié)(見細(xì)胞間連結(jié))。這些連結(jié)在發(fā)育過程中的出現(xiàn)和改變與發(fā)育信息傳遞的關(guān)系,也是受到注意的問題。
  發(fā)育程序的遺傳控制  在發(fā)育的研究中最重要而目前又最不清楚的是基因表達(dá)的時(shí)、空秩序,或發(fā)育程序的遺傳控制。從理論上講,進(jìn)化過程中形成的這種遺傳程序的邏輯結(jié)構(gòu)應(yīng)當(dāng)存在于基因組和基因本身的結(jié)構(gòu)中。對于基因數(shù)目少的發(fā)育系統(tǒng),如秀麗隱桿線蟲,有可能利用它的不同發(fā)育時(shí)期對溫度敏感的一系列突變型,測定不同基因起作用的時(shí)間,進(jìn)而分析發(fā)育程序的遺傳控制。然而,這是十分繁復(fù)而曠日持久的工作。
  控制果蠅體節(jié)發(fā)育的基因群,為研究這一重要問題提供了一個(gè)模式系統(tǒng)。在系統(tǒng)發(fā)育上,一般認(rèn)為果蠅是從四翅的昆蟲進(jìn)化來的,而昆蟲又是從多足的節(jié)肢動(dòng)物進(jìn)化來的。假定果蠅進(jìn)化過程中,演變出兩類基因:一類是抑制其多足類祖先腹節(jié)足的發(fā)育的基因;另一類是抑制其四翅祖先第 2對翅的發(fā)育的基因。如果這一假設(shè)是對的,后一類基因的突變將產(chǎn)生四翅的果蠅,前一類基因的變突將產(chǎn)生逾數(shù)的足。事實(shí)上,這兩類突變型都已發(fā)現(xiàn),有關(guān)的基因總稱為雙胸基因群(BX-C),包括至少 8個(gè)基因,按順序?yàn)椋篴bx,bx,ubx,bxd,pbx,iab-2,iab-5和iab-8。每一個(gè)位于前一位置的基因的產(chǎn)物控制該體節(jié)向后一體節(jié)轉(zhuǎn)化,如ubx基因控制中胸向后胸發(fā)育,其后的bxd基因控制后胸向第一腹節(jié)發(fā)育,如此等等;因而在個(gè)體發(fā)育中,BX-C基因群的作用順序就好象重演它們本身的系統(tǒng)發(fā)育順序。有人用遺傳學(xué)方法和重組DNA技術(shù),已得到一組包含有BX-C突變基因的DNA片段,正著手結(jié)構(gòu)分析,以揭示BX-C基因群結(jié)構(gòu)及其調(diào)控機(jī)制與基因進(jìn)化過程的關(guān)系。
  除核內(nèi)基因的控制外,卵質(zhì)本身的活動(dòng)還表現(xiàn)自主的時(shí)間程序,其分子機(jī)制還不清楚。
  最后,還應(yīng)提到從分子水平重新研究實(shí)驗(yàn)胚胎學(xué)未解決的一些古典問題,如卵的胚區(qū)定位,形態(tài)發(fā)生梯度和場區(qū)以及初級胚胎誘導(dǎo)作用等,仍然是分子胚胎學(xué)面臨的難題。
  參考書目
 T.Leighton and W.F.Loomis, ed.,The Molecular Genetics of Development, Academic Press,New York,London, Torants, Lydney,San Francisco,1980.

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