變形菌門

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變形菌門
大腸桿菌(E. coli)
大腸桿菌E. coli
科學(xué)分類
域: 細(xì)菌域 Bacteria
門: 變形菌門 Proteobacteria

變形菌門(Proteobacteria)是細(xì)菌中主要的一,包括很多病原菌,如大腸桿菌、沙門氏菌霍亂弧菌、幽門螺桿菌等著名的[1]也有自由生活(非寄生)的種類,包括很多可以進(jìn)行固氮的細(xì)菌。

卡爾·烏斯于1987年建立這個群組,非正式的稱這是“紫細(xì)菌及其親屬”。[2]變形菌門主要是由核糖體RNA序列定義的,名稱取自希臘神話中能夠變形的神普羅透斯(這同時也是變形菌門中變形桿菌屬的名字),因為該門細(xì)菌的形狀具有極為多樣的形狀。[3][4]

目錄

特性

所有的變形菌門細(xì)菌為革蘭氏陰性菌,其外膜主要由脂多糖組成。很多種類利用鞭毛運動,但有一些非運動性的種類,或者依靠滑行來運動。此外還有一類獨特的粘細(xì)菌,可以聚集形成多細(xì)胞子實體。變形菌門包含多種代謝種類。大多數(shù)細(xì)菌營兼性或者專性厭氧及異養(yǎng)或者自養(yǎng)化能生物生活,但有很多例外。很多并非緊密相關(guān)的屬可以利用光合作用儲存能量。因其多數(shù)具有紫紅色的色素,被稱為紫細(xì)菌。

分類

變形菌門根據(jù)rRNA序列被分為五類(通常作為五個綱),用希臘字母α、β、γ、δ和ε命名。其中有的類別可能是并系的。

α-變形菌除包括光合的種類外,還有代謝C1化合物的種類、和植物共生的細(xì)菌(如根瘤菌屬)、與動物共生的細(xì)菌和一類危險的致病菌立克次體目。此外真核生物線粒體的前身也很可能屬于這一類(參見內(nèi)共生學(xué)說)。

β-變形菌包括很多好氧或兼性細(xì)菌,通常其降解能力可變,但也有一些無機(jī)化能種類(如可以氧化氨的亞硝化單胞菌屬(Nitrosomonas))和光合種類(紅環(huán)菌屬(Rhodocyclus)和紅長命菌屬(Rubrivivax))。很多種類可以在環(huán)境樣品中發(fā)現(xiàn),如廢水或土壤中。該綱的致病菌有奈氏球菌目(Neisseriales)的中一些細(xì)菌(可導(dǎo)致淋病腦膜炎)和伯克氏菌屬(Burkholderia)。 在海洋中很少能發(fā)現(xiàn)β-變形菌。

γ-變形菌包括一些醫(yī)學(xué)上和科學(xué)研究中很重要的類群,如腸桿菌科(Enterobacteraceae)、弧菌科(Vibrionaceae)和假單胞菌科(Pseudomonadaceae)。很多重要的病原菌屬于這個綱,如沙門氏菌屬(Salmonella)(腸炎傷寒)、耶爾辛氏菌屬(Yersinia)(鼠疫)、弧菌屬(Vibrio)(霍亂)、銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)(就醫(yī)時引發(fā)的肺部感染或者囊性纖維化)。重要的模式生物大腸桿菌也屬于此綱。

δ-變形菌包括基本好氧的形成子實體的粘細(xì)菌和嚴(yán)格厭氧的一些種類,如硫酸鹽還原菌(脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)、脫硫菌屬(Desulfobacter)、脫硫球菌屬(Desulfococcus)、脫硫線菌屬(Desulfonema)等)和硫還原菌(如除硫單胞菌屬(Desulfuromonas)),以及具有其它生理特征的厭氧細(xì)菌,如還原三價鐵的地桿菌屬(Geobacter)和共生的暗桿菌屬(Pelobacter)和互營菌屬(Syntrophus)。

ε-變形菌只有少數(shù)幾個屬,多數(shù)是彎曲或螺旋形的細(xì)菌,如沃林氏菌屬(Wolinella)、螺桿菌屬(Helicobacter)和彎曲菌屬(Campylobacter)。它們都生活在動物或人的消化道中,為共生菌(沃林氏菌在牛中)或致病菌(螺桿菌在胃中或彎曲菌十二指腸中)。

參見

參考文獻(xiàn)

  1. Madigan, M. and J. Martinko. (eds.). Brock Biology of Microorganisms. 11th. Prentice Hall. 2005. ISBN 0-13-144329-1. 
  2. Woese, CR. [http//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC373105/ Bacterial evolution]. Microbiological reviews. 1987, 51 (2): 221–71. PMID 2439888. PMC 373105. 
  3. Stackebrandt, E.; Murray, R. G. E.; Truper, H. G.. Proteobacteria classis nov., a Name for the Phylogenetic Taxon That Includes the "Purple Bacteria and Their Relatives". International Journal of Systematic Bacteriology. 1988, 38 (3): 321. doi:10.1099/00207713-38-3-321. 
  4. Proteobacteria. Discover Life: Tree of Life [2007-02-09]. 

參考來源

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