醫(yī)學遺傳學/基因定位
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醫(yī)學遺傳學基礎 |
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基因組是生物的生殖細胞中所含全部基因的總和。人類基因組具有極其復雜的結構,其編碼蛋白質(zhì)的結構基因大約有100 000個,每個單倍體DNA含有3.2×109bp,分布在24條常染色體和X,Y性染色體上。此外,還含有大量的非編碼的重復DNA序列。基因定位(gene location)是用一定的方法將基因確定到染色體的實際位置。這是現(xiàn)代遺傳學的重要研究內(nèi)容之一。將不同的基因確定于染色體的具體位置之后,即可繪制出基因圖(gene map)。
有兩種基本方式制作人類染色體的基因圖:即物理作圖和遺傳作圖。物理作圖(physical mapping)是從DNA分子水平制作基因圖。它表示不同基因(包括遺傳標記)在染色體上的實際距離,是以堿基對為衡量標準,所以物理圖譜(physical map)最終是以精確的DNA堿基對順序來表達,從而說明基因的DNA分子結構。從細胞遺傳學水平,用染色體顯帶等技術在光學顯微鏡下觀察,將基因定位不同染色體的具體區(qū)帶,又稱區(qū)域定位(regiona assignmer),而把基因只定位到某條染色體上稱為染色體定位(chromosomalassignment)。這個水平上的基因圖譜又稱細胞遺傳圖(cytogenetical map)。分辨率可達5Mb至1Mb。遺傳作圖(geneticmapping)是以研究家族的減數(shù)分裂,以了解兩個基因分離趨勢為基礎來繪制基因座位間的距離,它表明基因之間連鎖關系和相對距離,并以重組率來計算和表示,以厘摩(cM)為單位。兩個遺傳座位間1%的重組率即為1厘摩。人類精細的遺傳圖水平可達1cM即100kb(1Mb)左右。
根據(jù)系譜分析和少數(shù)血型分析,就可確定某些基因位于X染色體上。X連鎖關系確定后,再依重組率計算兩者之間的相對距離,便可將兩個基因定位于XX染體的相對位置上,1961年紅綠色盲就是通過這種方法定位于X染色體上。
1968年Donahue依據(jù)系譜分析的原理,第一次將Duffy血型基因定位于第1號常染色體上。它在中期染色體時,發(fā)現(xiàn)1號染色體長臂1區(qū)的異染色質(zhì)區(qū)有變異特征。繼后,他發(fā)現(xiàn)在一些家族中,凡是具有這種形態(tài)特征的染色體都是Duffy血型者,從而將此血型的基因定位于第1號染色體上。伴隨分子生物學和細胞分子遺傳學的進展,基因定位的新方法不斷出現(xiàn),特別是體細胞雜交、分子雜交、DNA重組和DNA體外擴增(PCR)等技術后出現(xiàn)與應用,產(chǎn)生了許多定位新技術,如脈沖場凝膠電泳、染色體顯微攝影、染色體步移和酵母人工染色體(YAC)克隆等,使基因定位的研究工作得到迅速發(fā)展。
自1973年第一次國際人類基因組制圖(human genome mapping,HGM)會議召開以來,每隔2-3年就舉行一次會議。在第一次HGM會議上,人類基因定位只有31個,而今迅速進展到已定位的基因4000多個,而且有一大批克隆基因和DNA遺傳標記被定位,如表7-1所示。這些成果有力地推動了遺傳咨詢、基因診斷和基因治療的進展,對醫(yī)學理論和臨床實踐的發(fā)展起著十分重要的作用。
表7-1 HGM會議定位的克隆基因和DNA多態(tài)標記
HGM11(1999年) | CCM(1992年) | HGM12/CCM93(1993年) | |
基因總數(shù) 克隆基因 多態(tài)標記 |
2778 1524 622 |
3301 713 |
4183 3808 850 |
DNA節(jié)段總數(shù) 多態(tài)標記 克隆DNA |
6974 2608 9760 |
12376 3250 16277 |
25640 5114 29833 |
多態(tài)標記總數(shù) 微衛(wèi)星 |
3230 312 |
3963 812 |
5964 2427 |
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