醫(yī)學遺傳學/基因定位

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醫(yī)學遺傳學基礎

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基因組生物生殖細胞中所含全部基因的總和。人類基因組具有極其復雜的結構,其編碼蛋白質(zhì)結構基因大約有100 000個,每個單倍體DNA含有3.2×109bp,分布在24條常染色體和X,Y性染色體上。此外,還含有大量的非編碼的重復DNA序列。基因定位(gene location)是用一定的方法將基因確定到染色體的實際位置。這是現(xiàn)代遺傳學的重要研究內(nèi)容之一。將不同的基因確定于染色體的具體位置之后,即可繪制出基因圖(gene map)。

有兩種基本方式制作人類染色體的基因圖:即物理作圖和遺傳作圖。物理作圖(physical mapping)是從DNA分子水平制作基因圖。它表示不同基因(包括遺傳標記)在染色體上的實際距離,是以堿基對為衡量標準,所以物理圖譜(physical map)最終是以精確的DNA堿基對順序來表達,從而說明基因的DNA分子結構。從細胞遺傳學水平,用染色體顯帶等技術在光學顯微鏡下觀察,將基因定位不同染色體的具體區(qū)帶,又稱區(qū)域定位(regiona assignmer),而把基因只定位到某條染色體上稱為染色體定位(chromosomalassignment)。這個水平上的基因圖譜又稱細胞遺傳圖(cytogenetical map)。分辨率可達5Mb至1Mb。遺傳作圖(geneticmapping)是以研究家族的減數(shù)分裂,以了解兩個基因分離趨勢為基礎來繪制基因座位間的距離,它表明基因之間連鎖關系和相對距離,并以重組率來計算和表示,以厘摩(cM)為單位。兩個遺傳座位間1%的重組率即為1厘摩。人類精細的遺傳圖水平可達1cM即100kb(1Mb)左右。

根據(jù)系譜分析和少數(shù)血型分析,就可確定某些基因位于X染色體上。X連鎖關系確定后,再依重組率計算兩者之間的相對距離,便可將兩個基因定位于XX染體的相對位置上,1961年紅綠色盲就是通過這種方法定位于X染色體上。

1968年Donahue依據(jù)系譜分析的原理,第一次將Duffy血型基因定位于第1號常染色體上。它在中期染色體時,發(fā)現(xiàn)1號染色體長臂1區(qū)的異染色質(zhì)區(qū)有變異特征。繼后,他發(fā)現(xiàn)在一些家族中,凡是具有這種形態(tài)特征的染色體都是Duffy血型者,從而將此血型的基因定位于第1號染色體上。伴隨分子生物學細胞分子遺傳學的進展,基因定位的新方法不斷出現(xiàn),特別是體細胞雜交、分子雜交、DNA重組和DNA體外擴增(PCR)等技術后出現(xiàn)與應用,產(chǎn)生了許多定位新技術,如脈沖場凝膠電泳、染色體顯微攝影、染色體步移酵母人工染色體(YAC)克隆等,使基因定位的研究工作得到迅速發(fā)展。

自1973年第一次國際人類基因組制圖(human genome mapping,HGM)會議召開以來,每隔2-3年就舉行一次會議。在第一次HGM會議上,人類基因定位只有31個,而今迅速進展到已定位的基因4000多個,而且有一大批克隆基因和DNA遺傳標記被定位,如表7-1所示。這些成果有力地推動了遺傳咨詢、基因診斷基因治療的進展,對醫(yī)學理論和臨床實踐的發(fā)展起著十分重要的作用。

表7-1 HGM會議定位的克隆基因和DNA多態(tài)標記

HGM11(1999年) CCM(1992年) HGM12/CCM93(1993年)
基因總數(shù)
克隆基因
多態(tài)標記
2778
1524
622
3301
713
4183
3808
850
DNA節(jié)段總數(shù)
多態(tài)標記
克隆DNA
6974
2608
9760
12376
3250
16277
25640
5114
29833
多態(tài)標記總數(shù)
微衛(wèi)星
3230
312
3963
812
5964
2427

參看

32 遷移 | 基因定位的方法 32
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